张倩倩，女，博士，副研究员，硕士生导师。2006年获中国海洋大学环境生态学学士学位，2012年获中国海洋大学水生生物学博士学位，2010-2012年赴加拿大达尔豪斯大学进行联合培养博士学习。2014年和2018年先后赴加拿大英属哥伦比亚大学和泰国皇太后大学进行交流访问。主要研究领域为海岸带及近海环境真核微生物多样性、组学及分子生态学，原生生物应对极端环境的适应性进化。聚焦海岸带典型环境，综合细胞学、微生物学、分子生物学和生物信息学手段，开展微生物组学和分子生态学研究，旨在掌握微型真核生物群落对海岸带生境退化和全球气候变化的响应模式和适应机理，探讨微型真核生物对海岸带生物地球化学循环的贡献，研究结果可为海岸带生态环境评估和治理提供科技支撑。先后主持国家自然科学基金面上项目2项、青年基金1项、国家重点研发计划子课题1项、中科院青年促进会项目1项、国家海洋试点实验室重大科技专项子课题1项；并参与了山东省杰出青年计划、中科院战略性先导专项等课题研究。曾获国际原生生物学会Holz-Conor奖、山东省优秀博士论文等称号。至2022年3月，共发表SCI论文30余篇，授权国家发明专利1项，参与编写英文专著2部。

近期主持科研项目：

1、国家自然科学基金面上项目，海洋底栖纤毛虫：基于转录组的水平基因转移现象研究， 2022-2025，主持。

2、中国科学院青年创新促进会项目，近海典型生境真核微生物多样性研究，2019-2022，主持。

3、国家自然科学基金面上项目，海洋寡毛类纤毛虫的转录组分析与基因组系统学研究，2017-2020，主持。

4、国家自然科学基金青年项目，黄渤海寡毛类纤毛虫优势类群的多基因分子系统学分析，2014-2016，主持。

5、山东省重大科技创新工程专项子课题，近海与蓝碳系统微生物组学与适应机制，2018-2020，主持。

代表性论文：

1. Zou S, Zhang Q*, Gong J*(共同通讯). Comparative transcriptomics reveals distinct gene expressions of a model ciliated protozoa feeding on bacteria-free medium, digestible, and digestion-resistant bacteria. Microorganisms. 2020, 8, 559.

2. Fu Y, Zheng P, Zhang X, Zhang Q*, Ji D*(共同通讯). Protist interactions and seasonal dynamics in the coast off Yantai, northern Yellow Sea as revealed by metabarcoding. Journal Ocean University of China. 2020, 19 (4), 961-974.

3. Zou S, Zhang Q, Zhang X, Christine Dupuy and Gong J*. Environmental factors and pollution stresses select bacterial populations in association with protists. Frontiers in marine science. 2020, 7: 659.

4. Pan B#, Hou L#, Chen X#, Zhang Q#, Qu, Z; Warren, A, Miao M*(共同首作). Comparative genomics analysis of ciliates provides insights on the evolutionary history within“Nassophorea–Synhymenia–Phyllopharyngea” assemblage, Frontiers in Microbiology, 2019. 10: 0-2819.

5. Boscaro V, Santoferrara LF, Zhang Q, Gentekaki E, Syberg-Olsen MJ, Del Campo J, Keeling PJ.  EukRef-Ciliophora: a manually curated, phylogeny-based database of small subunit rRNA gene sequences of ciliates. Environmental Microbiology. 2018. 20(6):2218-2230.

6. Zhang X^#, Zhang Q^#, Yang A, Gong J*(共同首作).  Incorporation of microbial munctional traits in biogeochemistry models provides better estimations of benthic denitrification and anammox rates in coastal oceans. Journal of Geophysical Research. 2018, 123(10): 3331-3352.

7. Huang JB^#, Zhang T ^#, Zhang Q ^#, Li Y, Warren A, Pan H, Yan Y (共同首作). Further insights into the highly derived haptorids (Ciliophora, Litostomatea): phylogeny based on multigene data.  Zoologica Scripta. 2018, 47, 231–242

8. Zhang Q,  Agatha S, Zhang W, Dong J, Yu Y, Jiao N, Gong J.  Three rDNA loci-based phylogenies of tintinnid ciliates (Ciliophora, Spirotrichea, Choreotrichida). Journal of the Eukaryotic Microbiology, 2017, 64(2): 226-241.

9. Zhang Q, Táborsky P, Silberman JD, Pánek T, ？epi？ka I, Simpson AGB.  Marine isolates of Trimastix marina form a plesiomorphic deep-branching lineage within Preaxostyla, separate from other known trimastigids (Paratrimastix n. gen.). Protist. 2015,166:468–491.

10. Zhang Q, Simpson AGB, Song W. Insights into the phylogeny of systematically controversial haptorian ciliates (Ciliophora, Litostomatea) based on multigene analyses. Proceedings of Royal Society B. 2012. 279(1738)

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